Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms