Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms