Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif4P33174 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms