Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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