Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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