Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn10P28658 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atxn10P28658 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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