Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms