Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms