Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja1P23242 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja1P23242 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja1P23242 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja1P23242 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms