Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PparaP23204 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PparaP23204 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms