Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Edn1P22387 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Edn1P22387 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms