Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rpl13aP19253 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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