Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P18528 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18528 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms