Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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