Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms