Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01843 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms