Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn5O54942 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms