Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk2a2O54833 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms