Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms