Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms