Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20825J3QM67 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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