Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms