Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms