Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms