Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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