Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbf2E9PXF8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms