Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms