Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smok3bC0HKC9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms