Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms