Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms