Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms