Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SktA2AQ25 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms