Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms