Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms