Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27029A2A4P4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms