Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms