Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms