Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptgdr2Q9Z2J6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms