Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc23a1Q9Z2J0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms