Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms