Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abt1Q9QYL7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms