Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms