Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FancaQ9JL70 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancaQ9JL70 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms