Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx5Q9JL61 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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