Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp4Q9JKV5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms