Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms