Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chrac1Q9JKP8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrac1Q9JKP8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms