Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms