Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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