Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpraQ9DBG7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms